《中国社会科学院学部委员专题文集:科学与无神论文集》的主要内容包括：《科学与无神论》杂志的时代责任、《科学与无神论》创办三周年的回顾与展望、关于科学无神论学科建设的若干意见——在中国无神论学会2008年学术年会上的发言、一届联系实际思想开阔的学术聚会——记中国无神论学会2010年年会暨科学无神论的理论与实践研讨会、科学无神论和它的社会责任、科学无神论的学科建设和道路——在中国无神论学会2011年学术年会上的发言等。
自序
《科学与无神论》杂志的时代责任
《科学与无神论》创办三周年的回顾与展望
关于科学无神论学科建设的若干意见
——在中国无神论学会2008年学术年会上的发言
一届联系实际思想开阔的学术聚会
——记中国无神论学会2010年年会暨科学无神论的理论与实践研讨会
科学无神论和它的社会责任
科学无神论的学科建设和道路
——在中国无神论学会2011年学术年会上的发言
“人体科学”述评
《名人与名言》及名行
科学家为什么会参与迷信活动？
也谈“思维态度”
——评《迷信是人的一种思维态度》
校园当以科学拒绝邪教
在科学问题上明辨是非是校园拒绝邪教之径
科学无神论应该面向教育
在青少年中进行科学无神论教育的必要性和重要性
科学无神论必须进入大学校园
——一组有关调查和论文的述评
科学无神论教育与无神论研究
无神论是科学精神的一翼
先进文化中的价值尺度
——学习“以崇尚科学为荣、以愚昧无知为耻”心得
向全民普及科技知识和科学精神者致敬！
——科学工作者的一项神圣使命
“科学没有宗教是跛足的”什么意思？
科学态度 科学精神 社会道德
——读朱X X论藏传佛教
主编的话
我所知道的“反科学”思潮及其他
读《“舍利子”之谜》有感
关于开展科学无神论研究和教育之我见
构建和谐社会更应当理直气壮地宣传科学无神论
——答《中国党政干部论坛》记者梁丽萍问
谈宗教信仰自由问题
——无神论应否享有平等的言论自由？
试看{1998年国际宗教自由法案》中的“宗教自由”
关于美国对外关系中的宗教元素
——记媒体的一些有关论述
记中国无神论者与美国基督教徒的一次对话（摘要）
关于宗教神学进入国家教育系统和科研机构问题的商榷
为何选择“教育与宗教相分离”的话题座谈
——有关“两科座谈”事宜的通报
关于认真落实“国家实行教育与宗教相分离”立法的呼吁
——在“两科座谈”上的发言提纲
也谈“宗教市场论”及其在中国大陆“宗教文化”中的卖点
关于我国宗教学的马克思主义研究
中国的人本主义传统和无神论精神
中国传统文化中的民族精神和当前的文明建设
——学习十七大报告有感
儒学要与时代同行须强化与西方文化的对话
是谁在贬损中国人的自信力（摘要）
中国的宗教ABC
让什么主宰中国的命运：是鬼神信仰还是科学理性？
“研究宗教”亟须要拨乱反正“批判神学”必须开展补课
——《马克思主义研究》访谈稿
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