《糖组学研究技术》集实验教学的实用性和科学研究的前瞻性于一体,是国内第一部糖组学研究技术专著,因其创新性获得2013年度国家科学技术学术著作出版基金资助。《糖组学研究技术》共分为16章,介绍了糖组学研究常用技术和近年来编者实验室发明的新的研究技术(部分已经申请发明专利)。《糖组学研究技术》第一章重点叙述糖组学研究内容和技术应用,第二章至第十三章分别讲述各类糖组学实验技术,第十四章讲述糖组学数据统计分析方法,第十五章讲述用于糖组学研究的生物信息学技术,第十六章列举了国际上糖组学研究常用的数据库。 《糖组学研究技术》既适合研究生教学,也可作为参考书籍供生命科学研究各领域的相关人员使用。
李铮,1967年12月出生。1991年毕业于陕西师范大学化学系,获理学学士学位。1996年毕业于陕西师范大学化学系分析化学专业,获理学硕士学位。2000年毕业于西安交通大学生命科学与技术工程系,获博士学位。2001年获德国学术交流中心(DAAD)特别生物科学计划奖学金,在德国癌症研究中心(DKFZ)从事博士后工作。2004年就职于西北大学生命科学学院,开始从事糖组学相关技术的研究工作,目前已建立了一套进行糖组学研究的技术和方法;近三年在Journal of Proteome Research、Journal of Proteomics、Proteomics和PLoS ONE等期刊以通讯作者发表论文22篇;申请发明专利16项,其中已授权9项,获得计算机软件著作权2项;主持科技部国际科技合作计划、国家“863计划”和国家自然科学基金等11项国家级和省部级科研项目。
第一章 糖组学技术应用策略
第一节 糖组学研究概述
第二节 糖组学研究技术
参考文献
第二章 糖基因芯片技术
第一节 糖基因芯片的制备
第二节 应用实例
实例一糖基因芯片在肝癌细胞中的应用研究
实例二糖基因芯片在肝癌患者外周血中的应用研究
参考文献
第三章 凝集素芯片技术
第一节 凝集素芯片制备技术
第二节 应用实例
实例一凝集素芯片检测TGF-B1诱导肝星状细胞活化前后糖蛋白糖链谱
实例二凝集素芯片检测肝癌患者和健康志愿者唾液糖蛋白糖链谱
参考文献
第四章 凝集素组织化学技术与应用
第一节 凝集素组化技术
第二节 应用实例
实例一凝集素组化技术用于分析人肝癌组织、肝硬化组织、癌旁组织糖链表达
实例二凝集素组化技术用于分析小鼠纤维化肝糖链表达
实例三凝集素组化技术用于分析TGF-Bl诱导肝星状细胞糖链表达
参考文献
第五章 基于凝集素磁性微粒复合物的糖蛋白及其糖链的分离纯化技术
第一节 凝集素磁性微粒的制备
第二节 应用实例
实例一凝集素conA磁性微粒复合物应用于血清中糖蛋白的分离纯化及鉴定
实例二凝集素磁性微粒复合物应用于细胞中糖蛋白的分离纯化及鉴定
实例三凝集素磁性微粒复合物应用于活细胞表面膜糖蛋白的分离纯化及鉴定
参考文献
第六章 凝集素一磁性微粒复合物分离及其非标记的蛋白质质谱定量技术
参考文献
第七章 滤膜辅助凝集素分离糖肽及其糖基化位点分析技术
参考文献
第八章 酰肼化学法分离纯化糖蛋白/糖肽技术
第一节 酰肼化学法分离纯化糖蛋白/糖肽
第二节 酰肼功能化磁性微粒分离纯化糖蛋白/糖链
第三节 应用实例
实例酰肼树脂法分离纯化肝癌病人与健康志愿者血清糖蛋白、糖肽、末端唾液酸化糖肽
参考文献
第九章 亲水亲和分离纯化糖蛋白技术
第一节 亲水亲和分离技术
第二节 应用实例
实例亲水亲和技术分离纯化健康志愿者唾液糖蛋白
参考文献
第十章 滤膜辅助糖蛋白糖链的分离纯化及其结构质谱解析技术
第一节 滤膜辅助全糖蛋白N-连接糖链的分离
第二节 滤膜辅助糖蛋白O-连接糖链的分离
第三节 滤膜辅助的凝集素分离糖蛋白Ⅳ一连接糖链
参考文献
第十一章 糖芯片制备技术
第一节 糖芯片基本原理与操作
第二节 应用实例
实例一凝集素RcAl20的结合特异性分析
实例二糖芯片在TGF-pl诱导下人肝星状细胞研究中的应用
参考文献
第十二章 糖结合蛋白分离纯化技术
第一节 羟基化磁粒的制备
第二节 糖链一磁粒复合物的制备
第三节 糖结合蛋白的分离纯化
第四节 糖结合蛋白的鉴定方法
第五节 应用实例
实例肝癌患者和健康志愿者血清中甘露糖结合蛋白的分离纯化与鉴定
参考文献
第十三章 糖结合蛋白基因芯片技术
第一节 糖结合蛋白基因芯片制备技术
第二节 应用实例
实例糖结合蛋白基因芯片在肝癌研究中的应用
参考文献
第十四章 糖组学数据统计分析方法
第一节 引言
第二节 图像采集
第三节 数据预处理
第四节 寻找表达差异基因、蛋白质或糖链
第五节 聚类分析
第六节 统计分析软件及专家系统
参考文献
第十五章 用于糖组学研究的生物信息学技术
第一节 糖基化位点预测与鉴定方法
第二节 糖结合蛋白预测及分类
参考文献
第十六章 糖组学数据库
第一节 糖组学相关数据库
第二节 糖组学研究主要网络平台
参考文献
附录
一糖基因列表
二凝集素列表
三缩略语
四生物信息学相关数据库
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