《棉花分子育种学》》由总论、棉花分子标记研究进展、棉花基因工程、棉花分子聚合育种进展、转基因棉花安全评价、棉花分子育种展望6部分组成。
《棉花分子育种学》与棉花分子育种相关的主要学科为中心，全面阐述了棉花在上述学科中的主要研究进展，重点论述了分子标记辅助育种及基因工程在生物信息学及基因组学高速发展背景下的主要研究进展，分析了棉花分子育种中存在的主要问题，提出了棉花分子育种的最新进展及发展方向。
《棉花分子育种学》可以作为棉花遗传育种及生物技术研究人员、品种推广人员、科技管理人员、研究生等的参考用书，也可以作为相关领域研究人员的拳孝用书。
第1章 总论
1.1 棉花育种技术进展
1.1.1 我国棉花育种技术的发展与品种的系统更换
1.1.2 我国棉花育种技术创新
1.1.3 棉花主要性状的遗传研究进展
1.2 棉花生产及育种中存在的问题
1.2.1 我国棉花产业中存在的问题
1.2.2 我国棉花育种中存在的问题
1.3 分子育种概念的提出
1.3.1 分子标记育种
1.3.2 转基因育种
1.3.3 分子设计育种
主要参考文献
第2章 棉花分子标记研究进展
2.1 分子标记种类及新型标记开发
2.1.1 分子标记的种类
2.1.2 新型标记开发
2.2 分 子标记群体类型及分析方法
2.2.1 分子标记群体类型
2.2.2 分子标记群体的分析方法
2.3 棉花遗传图谱构建
2.3.1 如何构建分子连锁图谱
2.3.2 陆海种间遗传图谱研究进展.
2.3.3 陆地棉种内遗传图谱研究进展
2.3.4 棉花分子标记连锁群的染色体定位
2.4 重要性状的QTL定位
2.4.1 纤维产量性状的QTL定位
2.4.2 纤维品质性状的QTL定位
2.4.3 抗病性状的QTL定位
2.4.4 其他性状的QTL定位
主要参考文献
第3章 棉花基因工程
3.1 应用于棉花的主要基因及其遗传转化载体构建
3.1.1 现代基因分离策略和克隆技术及应用原则
3.1.2 重要基因的克隆及在棉花转基因育种中的应用
3.1.3 遗传转化载体系统
3.2 棉花细胞工程
3.2.1 棉花细胞工程的研究历史与现状
3.2.2 实验室设备及一般技术
3.2.3 原生质体培养和体细胞杂交
3.2.4 外植体的选择和灭菌
3.2.5 棉花体细胞胚胎发生与植株再生
3.3 棉花转基因技术发展
3.3.1 棉花规模化转基因技术体系平台建设及其应用
3.3.2 高效、安全转基因技术的研究进展
3.3.3 其他有应用价值的转化手段
3.3.4 其他转化技术及各转化技术的比较
3.4 转基因材料的筛选
3.4.1 标记基因筛选
3.4.2 转基因材料的抗性鉴定
3.4.3 转基因材料的遗传特征及稳定性分析
3.5 转基因技术体系平台建设
3.5.1 转基因技术体系平台建设概况
3.5.2 主要技术指标
3.5.3 主要服务对象
3.6 棉花转基因新材料创制
3.6.1 转化再生植株的移栽
3.6.2 再生植株的分子检测
3.6.3 转基因材料的创制概况
3.6.4 转 基因材料在生产中存在的问题
主要参考文献
第4章 棉花分子聚合育种进展
4.1 棉花分子标记辅助选择
4.1.1 遗传标记的类型及其特点
4.1.2 分子标记辅助选择的基本原理及其特点
4.1.3 分子标记辅助选择的基本方法
4.1.4 棉花分子标记辅助选择的意义
4.1.5 棉花分子标记辅助选择的研究进展
4.1.6 影响分子标记辅助选择（MAS）的因素
4.1.7 棉花分子标记辅助选择的基本策略
4.1.8 棉花分子标记辅助选择存在的问题及展望
4.2 转基因抗虫棉花新品种培育
4.2.1 用于抗虫研究的重要基因
4.2.2 抗虫基因的遗传与表达
4.2.3 转基因抗虫棉的生理特性及生长规律研究
4.2.4 抗虫基因对棉花农艺性状的影响
4.2.5 抗虫基因对棉花纤维品质性状的影响
4.2.6 转基因抗虫棉新品种培育
4.2.7 转基因抗虫棉新品种的应用
4.3 分子聚合培育高产、优质、多抗棉花新品种
主要参考文献
第5章 转基因棉花安全评价
5.1 安全评价内容和要求
5.1.1 安全评价的目的
5.1.2 安全评价的原则
5.1.3 安全评价的内容
5.1.4 各阶段安全评价的要求
5.2 转Bt基因棉花安全性研究进展
5.2.1 对棉铃虫控制作用
5.2.2 对主要害虫种群动态的影响
5.2.3 对自然天敌的影响
5.2.4 对棉田节肢动物群落的影响
5.2.5 不同种植条件下转Bt基因棉对节肢动物群落的影响
5.3 转Bt+CpTI基因棉花安全性研究进展
5.3.1 对棉铃虫的控制作用
5.3.2 对主要非靶标害虫的影响
5.3.3 对棉田节肢动物群落结构的影响
5.3.4 对自然天敌的影响
5.3.5 外源基因导入对棉株体内生化物质含量的影响
5.3.6 对土壤微生物的影响
5.3.7 外源基因漂移的研究
5.4 转基因抗除草剂棉花安全性研究进展
5.4.1 对草甘膦的耐药性
5.4.2 对棉田节肢动物群落的影响
5.4.3 对主要害虫种群动态的影响
5.4.4 对主要天敌种群动态的影响
5.4.5 对棉田主要病害的影响
主要参考文献
第6章 棉花分子育种展望
6.1 棉花结构基因组
6.1.1 棉花遗传图谱
6.1.2 棉花物理图谱
6.2 棉花功能基因组学
6.2.1 棉花功能基因组学研究的遗传材料
6.2.2 功能基因组学的主要研究手段
6.2.3 新一代测序技术在棉花转录组学研究中的应用
6.2.4 棉花蛋白组学研究进展
6.3 棉花全基因组测序
6.3.1 棉花基因组测序的意义
6.3.2 棉花基因组测序的策略
6.3.3 棉花细胞质基因组
6.3.4 棉花基因组学的最新进展
6.4 新基因的挖掘与利用
6.4.1 新型抗虫基因
6.4.2 抗病相关基因
6.4.3 抗逆相关基因
6.4.4 纤维品质和产量相关基因
6.4.5 棉花内源基因的分离和应用
6.5 转基因新技术
6.5.1 基因叠加
6.5.2 TALEN靶向基因敲除
6.5.3 纳米基因载体转化法
6.6 棉花分子设计育种
6.6.1 目前分子育种中存在的主要问题
6.6.2 棉花分子育种的发展方向
6.6.3 棉花分子育种未来发展任务
6.6.4 分子育种技术平台的建立
主要参考文献
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