全书据白云阁藏本白文序列编次，各难之后则由黄氏考究各家得失，证诸响经》旨趣，综合疏证并会通大意。书末另附黄氏纂辑之《秦越人事迹考》、《难经注家考》两篇。前者系其对《史记》扁鹊传记之笺疏；后者则集辑历代《难经》注家(包括日本学者)所撰书目，共计五十家，以稽其书之源流。
黄氏依据南京罗哲初所藏白云阁秘本《难经》予以阐释。注文多能析解先贤诸论,结合个人多年而读《难经》之心得,凡向之略而未尽者,皆详且备;疑而未晰者,皆辨且明。
黄竹斋，名谦，又名维翰，字吉人，竹斋亦其字，晚号中南山人，又号诚中子。祖籍陕西临潼，1886年7月13日生于长安（今西安市）。中医内科和针灸学家。自学成才，学识渊博。在学术上，尊古不泥，勇于探索，主张中西医团结合作。在仲景学说、针灸学、文献医史等研究方面，著述50多种，成绩甚著。诊疗工作中，独具匠心，尤以针药并施治疗中风偏瘫疗效突出。他聪颖过人，肯下苦功，弱冠时即能研读《伤寒论》 、 《金匮要略》 。1907年就写出《三阳三阴提纲》 ，对仲景学说提出自己的见解。
正文…………………………………………………… 1
秦越人事迹考…………………………………………… 163
难经注家考……………………………………………… 174
跋………………………………………………………… 185
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